De MR heeft adviesrecht; de school kan dit advies niet zondermeer naast zich neerleggen. Als de school een besluit neemt tegen het advies van de medezeggenschapsraad in, dan kan de medezeggenschapsraad de kwestie voorleggen aan een onafhankelijke geschillencommissie. Hiervoor moet de medezeggenschapsraad van mening zijn dat het besluit de belangen van de school dan wel de belangen van de medezeggenschapsraad ernstig schaadt. In dit geval zijn de wettelijke bepalingen over geschillen van toepassing.
